”使用差异“ 的搜索结果

     首先需要说明的是,limma是一个非常全面的用于分析芯片以及RNA-Seq的差异分析,按照其文章所说: limma is an R/Bioconductor software package that provides an integrated solution for...

     此文章是通过学习瑞典国家生物信息学...该部分是对不同集群之间的差异基因进行分析。参考来源:https://github.com/NBISweden/workshop-scRNAseq/blob/master/labs/seurat/seurat_05_dge.Rmd感兴趣的话可以阅读原文。

     差异表达分析通常作为根据基因表达矩阵进行生物信息学分析的第一步,有助于我们观察基因在不同样本中的表达差异,从而确定要研究的基因和表型之间的联系。常用的基因表达数据来自基因芯片或高通量测序。虽然矩阵看...

     注意:尽量不要直接git pull,因为git pull会隐藏一些中间细节,它会直接将远程主机的最新内容合并到当前分支,建议使用:git fetch和git merge # 拉取远端master到本地 git fetch origin master # 切换至想要的...

     使用的图像分为两类,一类是用于训练差异模型的图像;另一类是用于测试的图像,即实际检测图像。其中,图像如果是彩色的,需要将其转换成灰度图。如果存在一定的噪声,需要通过平滑去噪等预处理。当然,如果图片质量...

     因为支持的业务方比较多,而且Pod库会在多个App中被使用,那么同一个Pod库如何在多端做差异化处理,以及具体做到什么粒度,在这里简单总结一下。 方案: 一、预编译宏 使用类似 #if __has_include 等预编译宏,...

     对比俩张图片差异,可以用均方误差(MSE)与结构相似性指数(SSIM)函数。(Mean Squared Error vs. Structural Similarity Measure) 尽管MSE的计算速度要快得多,但它的主要缺点是(1)全局应用,(2)仅估计图像...

     平时工作期间,我们有可能遇到对比两个文件内容的差异性,并将两个文件差异的内容输出,这个时候我们可以使用shell脚本来操作,使用shell脚本的sort排序后再比对,这种方法在数据量大的情况下,比循环比对速度快很多...

     用limma对芯片数据做差异分析 用limma对芯片数据做差异分析 jmzeng 2016年3月12日 用基因芯片的手段来探针基因表达量的技术虽然已经在逐步被RNA-seq技术取代,但毕竟经历了十多年的发展了,在GEO或arrayexpress...

     上一篇写了用champ.load导入甲基化数据,成功导入之后就可以做一系列的流程了,我主要是根据ChAMP包的说明和生信技能树的甲基化芯片分析来学习这个整体流程的。 首先是安装包 # 首先要有Bioconductor ,然后用代码:...

     写在前面:最近在使用limma包进行差异表达分析,参考了网上许多教程都觉得说的云里雾里,很不清楚。经过我自己一段时间非常痛苦的钻研,弄明白了,解决了我的实际需求。于是决定将我的分析经验写下来,分享给需要的...

     CPTAC蛋白质差异分析 文章目录CPTAC蛋白质差异分析@[toc]1. CPTAC数据下载2. 数据补缺校正3. 数据分组4. 蛋白质组差异分析 1. CPTAC数据下载 根据自己的需求选择对应的癌症,然后下载,这里就不展开讲了。以下为下载...

      在项目实践中,经常存在货物已经发出,但不能及时确认收入的情形,比如: (1)运输在途 (2)报关出品手续未完成 (3)客户验收需要时间等 (4)合同争议等 为确保收入与成本的同步(至少不跨月),同时,确保账...

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