使用差异 - 程序员宅基地

使用Tortoise结合Git比较两个版本的差异

1、右键项目，TortoiseGit -------> Diff with previous version 2、单击出分支选择弹窗，进行选择要比较的两个分支 3、比较同个分支的两个不同的版本 ...show log ----->通过按Shift 和鼠标左键, 可以选中...

用Python进行GEO数据挖掘（学习笔记三）：利用rpy2库调用R的limma包进行差异表达分析

标签：数据挖掘学习 python

本文详细介绍python进行差异表达分析的详细流程，其中用到了rpy2库调用了R中的limma包，最后提取了差异基因，并可视化结果。

哈佛大学——差异表达分析（十二）可视化

标签：生物信息学 r语言数据分析

文章目录学习目标结果可视化绘制显著DE基因使用DESeq2 `plotCounts()`绘制单个基因的表达...在这节课中，我们将让你开始一些基本的和更高级的图形，通常用于探索差异基因表达数据，然而，这些图形中的许多也可以帮助可

一文弄懂什么是差异备份和增量备份

标签： mysql 增量备份差异备份

一文弄懂什么是差异备份和增量备份文章目录一文弄懂什么是差异备份和增量备份前言1.概念1.差异备份概念2.增量备份概念2.差异备份和增量备份的区别总结前言有很多人分不清什么是差异备份和增量备份，我就来简单的...

几种常用的差异分析方法简介

但是在实际应用中，大多数人不知道该使用哪种方法来处理自己的数据，所以今天我就来介绍下目前几种常用的差异分析方法及其适用场景。 1.方差分析、T检验、卡方检验、秩和检验其实核心的区别在于：数据类型不一样...

math 百分比误差、百分比差异、百分比变化

标签：百分比变化百分比差异百分比误差

将近似值与精确值进行比较时使用百分比误差. 忽略减号（不要理会），除非您想知道误差是低于还是高于准确值 "百分比误差"的公式: 百分比误差=∣近似值−准确值∣∣准确值∣×100% \mathrm{百分比误差}=\frac{\left|...

差异性检验统计

最近我发现，大家对T检验的使用频率很高，但是有一个共同的应该引起注意的问题，几乎没有人去讨论原始数据的正态分布情况，只要是两样本差异检验，就直接使用T检验出结果。严格来说，这是不严谨的。为什么呢？因为T...

用Cufflinks计算差异表达

使用Cufflinks计算差异表达 Cufflinks包含了以下程序： Cufflinks 使用经过Tophat比对好的SAM格式来拼接转录组（每一个样本都进行拼接），如果有基因组注释文件的话，效果会更好。这个步骤的目的在前面已经讲过，...

ggplot2之配对数据差异比较及结果可视化

标签：数据可视化 html css

写在前面从元旦之前，由于工作确实非常的多，所以更新的频率持续下降，现在基本上是周更了，这种情况应该还会要持续一段时间，可能要到4月或者5月才能恢复正常的更新频率。上一次给大家带来结果可视化...

完全备份、差异备份和增量备份的区别

标签：数据库 database 数据备份

数据备份3种方式以及区别

差异表达基因热图怎么看_热图的解读及边界聚类的意义

标签：差异表达基因热图怎么看

热图（heatmap）是分子生物学文章里（尤其是microarray, RNA-seq相关论文）经常出现的图片。但热图一般有哪些用途，具体涉及哪些不同的参数...第一个很容易理解，通过使用颜色（例如红绿的深浅）来展示多个样本多个...

R统计计算--差异性检验

标签：差异性检验

差异性检验: t检验、秩和检验（如wilcox检验）、Kolmogorov-Smirnov检验组间差异检验：方差分析、Fisher检验、卡方检验相关性分析：相关性检验（pearson、spearman和kendall等）、cos相关性检验基本概念： 1....

miRNA seq差异表达分析练习（二）——DESeq差异表达分析

标签： r语言数据分析生物学

接上一篇《miRNA seq差异表达分析练习（一）——GEO样本数据下载》，下载的数据保存在文件夹miRNA_seq中有60个txt.gz文件从后缀名可以看出，这些都是压缩文件，直接打开是乱码的，解压后打开就可以看到具体...

Python difflib库实现文本文件的差异比较

difflib 是 Python 的标准库，用于对序列 (sequence) 进行比较，以便于人类理解的方式标记差异，也可以将差异输出到 html 文件，以高亮的方式显示差异。本篇讲述如何使用 difflib 库来比较文本文件的差异

Git diff 使用 vimdiff 对比差异

标签： git diff difftool vimdiff

在Ubuntu中使用Git时，可使用命令行的git diff命令来对比两次提交的差异，但是这种对比查看方式无法直观地查看修改的差异，在对比和查看时不太方便。可以使用vimdiff作为Git diff的对比工具，这样就方便了许多，...

GEO数据库学习四(差异分析可视化 GSEA)

标签：学习

定义：在某一特定基因子集中，多个基因共同...，其中N：所有gene总数n：N中差异表达gene的总数M：N中属于某个GO term的gene个数k: n中属于某个GO term的gene个数p：表示差异表达gene富集到这个GO term上的可信程度当p

命令行使用SVN以及指令获取SVN中的差异列表文件和其中的错误处理

标签： SVN 不是内部或外部命令，也不是可运行的程序或批处理文件

我们需要使用的指令： svn diff -r COMMITTED:HEAD --summarize [需要获取的库的路径] &gt; [生成的差异列表文件的路径以及名字] 举例： svn diff -r COMMITTED:HEAD --summarize F:\XxMobileCode...

使用Notepad++来比较两个文件的差异

Notepad++，也叫npp，是一款类似于记事本的开源小软件。它运行便携，体积小、资源占用小，支持众多程序语言，比如C++、C#、Java 等主流程序语言；...而且Notepad++做为程序员们最喜爱的编辑器之一，像语法高亮，语法...

统计假设检验显著性差异

假设检验的显著性差异检验主要是用来比较两组或多组数据中，是否每组数据对结果的影响基本一致。换言之，这是用来判断每组数据代表的因素中，是否有主要影响因素。大致思路是先检验各组数据是否有显著性差异，再...

geo数据差异分析_GEO2R:对GEO数据库中的数据进行差异分析

标签： geo数据差异分析

GEO数据库中的数据是公开的，很多的科研工作者会下载其中的数据自己去分析，其中差异表达分析是最常见的分析策略之一，为了方便大家更好的挖掘GEO中的数据，官网提供了一个工具GEO2R, 可以方便的进行差异分析。...

SAP 物料差异来源

可将SAP的差异来源分成以下几类： 1、物料移动产生的差异 A、 PO收货时,采购价格和标准价格不同产生差异。配置： OBYC-PRD-PRA 凭证： Example: PO采购原材料800800，100个，单价为1.2元。但是原材料800800...

git如何查看两次上传的差异_git 查看对比的方法log diff

标签： git如何查看两次上传的差异

1.有冲突时可以用 git status查看git log -1 HEAD 基于当前commit上一次的提交loggit log -p -2 除显示基本信息之外，还显示每次提交的内容差异，-2 意思是仅显示最近两次提交。特别适用于进行代码审查，或者快速...

Git 仓库下如何通过 diff 功能进行差异比对

标签： git android studio gui

大纲 1. 背景 2. 方案 2.1 SourceTree 查看差异 2.2 git difftool 查看差异 2.3 git diff 输出差异文件 ...包括一些 wiki 平台，底层也使用了 Git 进行版本管理，提供了查看文档修改记录、多版

limma包分析差异表达基因

标签： r语言生物信息学

limma利用广义线性模型进行差异表达基因分析，主要用于分析微阵列数据。 Data analysis, linear models and differential expression for microarray data. 1. 读入基因表达谱数据 exprSet <- read.delim...

使用Python 比较mysql数据库中两个数据库的表结构，并导出差异部分的表结构

在web开发中，通常情况下...一般可以使用migration等工具控制这种情况的发生，但是针对没有使用这类自动化工具的时候，我们可以用Python写一个脚本检测比较正式上线的数据库和测试开发的数据库的表结构差异，避免出错！

python归一化增大差异_归一化&标准化

标签： python归一化增大差异

1、归一化是将数值放缩到[0, 1]或者[-1, 1]常用于机器学习计算多个不同量纲的特征映射到[0, 1]或者[-1, 1]，所以该值受有最大值和最小值决定2、z-score由于Z-score的数据分布满足“正态分布”(N(0,1))，而“正态分布...

单细胞测序两组差异分析—seurat包

标签： r语言 python

尝试使用seurat包进行两组间差异分析使用的是seurat包自带的数据 #首先载入需要的包 library(Seurat) #安装seurat-data包 install.packages('devtools') library("devtools") devtools::install_github('satijalab...